Dopo aver effettuato il check-in, prima di recarsi all'imbarco, è necessario effettuare i controlli di sicurezza presso gli appositi varchi presidiati da personale della società Aeroporti di Roma e dotati di metal detector e altre apparecchiature di sicurezza.

Per i voli extra Schengen, prima delle aree d'imbarco H e G, è necessario eseguire il controllo passaporti, effettuato dalla Polizia di Stato.